国家卫计委指出，《传染病防治法》的全面修订，就是要总结分析疫情防控暴露出的不足和薄弱环节，明确重点难点问题，有针对性地开展修订工作。专注于改善公共卫生法律体系,并设计相关的系统,以确保它们符合“国境卫生检疫法律中华人民共和国”,“动物防疫法律中华人民共和国”,“中华人民共和国紧急反应法”和其他法律。加强对公众健康的法律保护。
根据征求意见稿，本次修订的重点是预防和控制不明原因的集群性疾病。在A、B、C、C三类法定传染病基础上，增加“具有传染病流行病学特征的不明群体性疾病”，进一步完善有针对性的报告和管理控制措施。
修订计划完善传染病报告制度。明确各级各类机构的报告职责和时限要求，建立报告奖励和责任免除制度。例如，第三十六条规定，国家对发现、报告具有传染病流行病学特征的原因不明的群体性传染病和新的传染病的单位和个人，按照国家有关规定给予奖励;逾期不履行的，不追究有关单位和个人的责任。
修订《传染病信息公开制度改革方案》。第四十三条规定,提出了中国疾病预防控制中心将定期公布全国法定传染病疫情信息,和疾病控制机构县级或以上将定期发布法定传染病疫情信息在他们的行政区域。传染病发生或者流行时，由县级以上地方人民政府卫生行政部门公布本行政区域内的疫情信息;传染病跨省爆发或者流行时，由国务院卫生行政部门负责公告。
